说点什么吧~
一、真核生物基因组的特点: ,
①真核基因组 DNA 在细胞核内处于以核小体为基本单位的染色体结构中.
②真核基因组中,编码序列只占整个基因组的很小部分(2—3%),
二、真核基因组中 DNA 序列的分类 •
(一)高度重复序列(重复次数>lO5)
卫星 DNA(Satellite DNA)
(二)中度重复序列
1.中度重复序列的特点
①重复单位序列相似,但不完全一样,
②散在分布于基因组中.
③序列的长度和拷贝数非常不均一,
④中度重复序列一般具有种属特异性,可作为 DNA 标记.
⑤中度重复序列可能是转座元件(返座子),
2.中度重复序列的分类
①长散在重复序列(long interspersed repeated segments. ) LINES
②短散在重复序列(Short interspersed repeated segments) SINES
SINES:长度<500bp,拷贝数>105.如人 Alu 序列
LINEs:长度>1000bp(可达 7Kb),拷贝数 104-105,如人 LINEl
(三)单拷贝序列(Unique Sequence)
包括大多数编码蛋白质的结构基因和基因间间隔序列,
三、基因家族(gene family)
一组功能相似且核苷酸序列具有同源性的基因.可能由某一共同
祖先基因(ancestral gene)经重复(duplication)和突变产生。
基因家族的特点:
①基因家族的成员可以串联排列在一起,形成基因簇(gene cluster)或串联重复基因(tandemly
repeated
genes),如 rRNA、 tRNA 和组蛋白的基因;
②有些基因家族的成员也可位于不同的染色体上,如珠蛋白基因;
③有些成员不产生有功能的基因产物,这种基因称为假基因 (Pseudogene).
Ψa1 表示与 a1 相似的假基因.
假基因分类。加工过的假基因(processed pseudogene)。
典型的基因家族
1. tRNA 基因
单倍体人基因组中 1300 个 tRNA 基因, tRNA 基因簇.
2. rRNA 基因
>l00copy. rRNA 基因簇(重复单元 28S、 18S、 5.8s-rRNA)
3.组蛋白基因
30-40copy.定位: 7q32-q36
组蛋白基因簇(重复单位: H1, H2A, H2B, H3、 H4)
特点:无 intron, Poly(A)- RNA.
4.珠蛋白基因
α类: 16p13,基因簇(24Kb): 5’—ζ—Ψζ—Ψα1—α2—α1—3’
β类: 11p15,基因簇(60Kb): 5’— ζ—Gr—Ar—Ψβ—δ—β—3’
四、超基因家族(Supergene family , Superfamily)
由基因家族和单基因组成的大基因家族,结构上有程度不等的同源性,但功能不同.
五、人类基因组中的重复序列标记
1、 A1u 序列
单倍体人基因组 50 万-100 万拷贝,平均每隔 3-6Kb 就有一个 Alu 序列,
人 A1u 序列长 300bp:
2X130bp 重复序列;
+31bp 间隔序列(中间);
两侧 7-21bp 正向重复(direct repeats),返座子?
Alu 序列广泛散布于人基因组,约 90%巳克隆的人基因合有 Alu 序列
Alu 序列标志。
2、可变数串联重复 • , •
Variable number tamdem repeat, VNTR.
又称小卫星 DNA(minisatellite DNA)
由短重复单位(6-40bp)串联重复(6-100 次以上)而成,多位于基因的非编码区,广泛分布。
VNTR 多态性—分子标记—DNA 指纹图( fingerprint) .
小卫星 DNA 突变与肿瘤, H-Ras。
3、短串联重复( short tandem repeat,STR)
又称微卫星 DNA( microstallite DNA)
2-6 个核苷酸组成的重复单位串联重复(10-60 次),两侧为特异的单拷贝序列,人基因组中每
l0kb
DNA 序列至少一个 STR 序列。
{CA)n, 50, 000-100, 000 拷贝.
新一代遗传标记,人类基因组研究,肿瘤,遗传病.
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